Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zyg11bQ3UFS0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zyg11bQ3UFS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms