Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U1D9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms