Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hace1Q3U0D9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms