Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms