Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms