Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdnep1Q3TP92 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdnep1Q3TP92 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdnep1Q3TP92 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms