Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Defb33Q30KN3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Defb33Q30KN3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Defb33Q30KN3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Defb33Q30KN3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Defb33Q30KN3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Defb33Q30KN3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb33Q30KN3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms