Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shroom4Q1W617 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom4Q1W617 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom4Q1W617 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom4Q1W617 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom4Q1W617 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shroom4Q1W617 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
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Shroom4Q1W617 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
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Shroom4Q1W617 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
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Shroom4Q1W617 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
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Shroom4Q1W617 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
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Shroom4Q1W617 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shroom4Q1W617 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
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Shroom4Q1W617 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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Shroom4Q1W617 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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Shroom4Q1W617 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Shroom4Q1W617 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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