Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sap25Q1EHW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms