Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VgfQ0VGU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms