Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gli2Q0VGT2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms