Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttc39dQ0VF76 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms