Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd12Q0VE29 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms