Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Neurl1bQ0MW30 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Neurl1bQ0MW30 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms