Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrioQ0KL02 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms