Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kndc1Q0KK55 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kndc1Q0KK55 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms