Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf541Q0GGX2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf541Q0GGX2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms