Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700061G19RikQ08EE8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms