Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou6f1Q07916 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms