Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ebf1Q07802 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms