Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah1bQ06985 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms