Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CluQ06890 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CluQ06890 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CluQ06890 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CluQ06890 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CluQ06890 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms