Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms