Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emx1Q04742 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emx1Q04742 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms