Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd1Q04519 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms