Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms