Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha4Q03137 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms