Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EgfrQ01279 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EgfrQ01279 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms