Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Grin2bQ01097 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Grin2bQ01097 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms