Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brca2P97929 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brca2P97929 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brca2P97929 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms