Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AlkP97793 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AlkP97793 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AlkP97793 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AlkP97793 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AlkP97793 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AlkP97793 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AlkP97793 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AlkP97793 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AlkP97793 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AlkP97793 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AlkP97793 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AlkP97793 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AlkP97793 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AlkP97793 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AlkP97793 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AlkP97793 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AlkP97793 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AlkP97793 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AlkP97793 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AlkP97793 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms