Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd1P97443 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd1P97443 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd1P97443 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd1P97443 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smyd1P97443 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smyd1P97443 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms