Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis3P97368 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis3P97368 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis3P97368 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms