Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cct5P80316 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cct5P80316 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms