Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1bP70700 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms