Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tp53bp1P70399 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tp53bp1P70399 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms