Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp4P70343 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Casp4P70343 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms