Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54lP70270 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54lP70270 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms