Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf5P70191 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf5P70191 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms