Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SnrpnP63163 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms