Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp2P63044 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms