Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27aP62983 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms