Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3P62908 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3P62908 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms