Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tbpl1P62340 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms