Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf6P62331 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arf6P62331 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arf6P62331 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arf6P62331 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arf6P62331 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arf6P62331 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms