Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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