Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Polr3bP59470 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms