Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CgnP59242 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CgnP59242 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CgnP59242 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CgnP59242 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CgnP59242 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CgnP59242 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms