Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp5bP56480 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp5bP56480 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms