Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CdaP56389 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CdaP56389 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CdaP56389 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CdaP56389 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CdaP56389 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CdaP56389 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CdaP56389 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CdaP56389 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CdaP56389 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CdaP56389 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CdaP56389 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CdaP56389 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CdaP56389 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms